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羧肽酶 B (EC 3.4.17.2) 專一用于蛋白質 C-末端堿性氨基酸（賴氨酸、精氨酸、組氨酸）的水解；又稱為肽酰-L-賴氨酸（L-精氨酸）水解酶；精蛋白酶。分子量為 35kD，等電點為 6.0，zui適 pH 為 7-9。羧肽酶 B 是抗體堿性峰檢測的特異酶，通過比較酶切前和酶切后的圖譜來計算抗體堿性變體的比例，對于抗體的發酵工藝和純化工藝穩定性的控制都具有重要的意義。
而在抗體堿性峰的檢測中，沒有*統一的標準，如酶解緩沖液酶的用量，酶解時的溫度和時間等。而這些與酶的性質密切相關。
可以選擇的羧肽酶 B 有兩種，一種是動物胰腺提取的羧肽酶 B，一種是基因工程的重組羧肽酶 B，前者由于胰腺中含有各種蛋白酶，如胰蛋白酶、糜蛋白酶等，常常不能*去除，在酶切時會有非特異的酶切雜峰出現，影響結果判斷。后者為基因工程生產的，成分單一，無雜酶，比活高，應用上更有優勢。
羧肽酶 B 的結構
天然存在的羧肽酶 B 是由前羧肽酶原 B（preprocarboxypeptidase B，preproCPB）經酶解產生，后者 N-末端包含 108 個氨基酸（其中 13 個氨基酸為信號肽序列，95 個氨基酸組成前導肽部分）的多肽片段與 CPB 相連。前羧肽酶原 B 在轉運到內質網的過程中，信號肽被切掉，得到無酶活性的羧肽酶原 B（procarboxypeptiedase B, proCPB）并從細胞中分泌出來，zui終在小腸中經胰蛋白酶在 Arg-95 處酶解，成為具蛋白酶活性的 CPB。proCPB 的分子量為 46kD，由 401 個氨基酸組成；CPB 分子量為 35kD，由 306 個氨基酸組成（如圖 1）。在CPB 中，前體的活化主要依賴胰蛋白酶在 Arg95 位的切割，半球形前導肽被切割后，它既不會抑制酶體，也不再與之結合，這使得酶體能迅速發揮功能，并對前導肽 C-端的 Arg 進行切割。
圖 1 羧肽酶原 B 的三維結構及其激活部位示意圖
（上面暗紅色部分代表前肽，下面藍色部分代表羧肽酶 B，箭頭所指為胰蛋白酶酶切激活位點）羧肽酶 B 的性質取重組羧肽酶 B 凍干粉，純度見圖 2。研究了重組羧肽酶 B 的zui適 pH，zui適溫度，pH 穩定性及溫度穩定性，對于 CPB 的使用起到指導作用。同時做了溶液的反復凍融穩定性，對于 CPB 酶液的儲存和使用起到指導作用。
圖 2 純化后重組羧肽酶 B 的電泳分析
1、羧肽酶 B 的 pH 穩定性
將純的重組羧肽酶 B 用純水溶解為 10 mg/ml，之后用以下緩沖液稀釋使酶液的終濃度為 1 mg/mL，pH 分別為 3.0、4.0、5.0、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0、10.0、11.0、12.0， 25℃ 孵育 12 h 后測活。結果見圖 3（左）。
2、羧肽酶 B 的zui適 pH
測定 rCPB 純酶液濃度為 1 mg/mL, 在不同 pH 條件下的催化速率，底物濃度為 0.1 mM/L，pH 分別為 3.0、4.0、5.0、6.0、6.5、7.0、7.5、7.65、8.0、8.5、9.0、10.0、11.0、12.0，pH3.0-5.0 用 50 mMNaAc-HAc 緩沖液配制，pH6.0-7.0 用 50 mMKPB 磷酸鹽緩沖液配制，pH7.5-8.5 用 50 mM Tris-HCl 緩沖液配制，pH9.0-12.0用 50 mM Gly-NaOH 緩沖液配制。結果見圖 3（右）。
圖 3 rCPB 酶液的 pH 穩定性（左）和zui適反應 pH（右）CPB 在 pH7.0-9.0 緩沖液中穩定，25℃ 孵育 12 h 無活性損失；zui適 pH 表明，在 pH7.6 活性zui大，在 pH7.5-pH8.5 活性均可以。在 pH≤7 和 pH≥10 時，基本無活性。
3、羧肽酶 B 的溫度穩定性
將 rCPB 酶液配成濃度為 1 mg/mL，置于 4℃、25℃、30℃、40℃、50℃、60℃ 條件下，每個溫度三個平行，時間定為 15 min、30 min、1 h、2 h、4 h、8 h、20 h 分別取樣測定其活性，以初始時酶活定為 100%，以殘余酶活百分比表示測定結果。
4、羧肽酶 B 的zui適催化溫度
在不同溫度下恒溫水浴測活底物，使底物的溫度分別為 4℃、25℃、30℃、40℃、50℃、60℃、70℃、80℃，取適量 rCPB 純酶液，測定活力。以 254nm 吸光值 OD254 為縱坐標，時間為橫坐標，結果表示見圖 4（右）。
圖 4 rCPB 酶液的溫度穩定性（左）和zui適催化溫度（右）CPB 在 40℃ 以下保溫 10 h，均活性穩定。zui適催化溫度顯示，在 3 min 內，40℃以下均可保持良好的線性，其中，以 25℃ 為*。
5、羧肽酶 B 酶液的反復凍融穩定性
將 rCPB 酶液反復凍融，測定每次凍融后的酶活，計算活力保留率，得到同一管 rCPB 反復凍融 10 次后的活力穩定性（如圖 5）。
圖 5 rCPB 酶液的反復凍融穩定性
結果表明重組羧肽酶 B 反復凍融穩定性好。經過 10 次的反復凍融，幾無活性損失。
抗體堿性峰檢測
羧肽酶 B 的準備：用 1X PBS pH7.5, 溶解羧肽酶 B 至 1 g/L，分裝后-20℃ 保存。
抗體：純化后的單抗樣品超濾至磷酸緩沖液（pH=7.5）中（1~2 g/L）。
酶用量：按樣品：酶= 20:1-100:1，此處用量為 100:1。
孵育溫度及時間：37℃ 反應 30 分鐘。
檢測：直接進樣 HPLC 檢測。
結果見圖 6。
圖 6 抗體經 CPB 處理和未處理的圖譜比較
圖 7 Rituimab 羧肽酶 B 處理前后比較圖（摘自 Rituximab 的 USP 驗證報告）在 Rituximab 的 USP 驗證報告中，規定了酸、堿性變體的含量。規定 Rituximab的酸性變體 NMT 12.0% ，堿性變體 NMT 10.0%。鑒定方法為 CPB 處理前后的HPLC 比較。
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